讲述了一代人王大禹的少年时代历经磨难，带领族人守护家园、与洪水猛兽斗争的传奇故事。片中许多山海经里的神话角色，如：应龙、共工、神龟、神鸟、相柳、盘古山等，让观众对上古时期的人文地理有一定了解。

　　忍者神龟们发现了变种物质的泄漏之处,但史莱德同时也发现这一秘密,于是他们之间又展开了新一轮的战斗,而忍者神龟们也在战斗中得到了提高!

　　忍者神龟被一把神奇的魔杖传送到了17世纪的日本,他们将在那里对抗邪恶的Norinaga勋爵,并夺回魔杖拯救纽约市!

　　讲述了忍者神龟与蝙蝠侠跨时空相遇，他们本都是默默守护正义的使者。然而在铲除罪恶的过程中蝙蝠侠和忍者神龟产生了误解，经过一系列打斗后，解除彼此的误解，共同作战，守护城市的和平以及人们的安全。