位于南洋腹地的一个无名小岛，隐藏着一个科技发达的实验室。实验室中，一个未知的生命正在孕育。此前不久，疯狂的科学家们在某个远古遗迹提取到了最强宝可梦梦幻的基因，随后利用现代科技，提供基因提升改造，人

　　被人类用基因技术克隆出来的最强宠物小精灵超梦（市村正亲 配音）带着对自我身份的疑惑和对人类强大的愤怒逃离了科研所，它宣布要对制造出自己的人类进行复仇。　　已经得到了八个勋章的小智（松本梨香 配音）