罗杰、莉莎、司徒若琳三人，被邪恶博士抓到实验室，准备利用他们来完成自己基因战士培养的邪恶计划。过程中三人身体里面的超能力被激活，逃出了实验室。博士一心想着自己的邪恶计划，对三人穷追不舍，三人在司徒

　　科学家赵谦教授倾注了毕生心血终于成功研制出了高效原子电池，可是，正当他准备把成果奉献给祖国之时，却遭人暗杀，电池落入了他的准女婿陈天虹（乔榛 饰）的手中。陈天虹一路保护着电池，却遭到了特务沙布罗夫

　　19世纪的中国，博士、Yaz和Dan误打误撞来到广东沿海一个小渔村，在遇上著名女海盗郑一嫂后，深藏在深海恐怖的海魔阴谋慢慢浮现，博士能联合郑一嫂与同伴们阻止海魔释放恐怖的力量吗？

20世纪60年代，美国的势力向亚洲渗透，为此政府实行的一项绝密计划——战士再造计划，通过药物注射等手段将士兵大造成冷血无情、实力强悍的超级战士。随着技术不断改进，在罗伯特·柯林博士的主持下又开启了白塔

　　前工程师斯科特（保罗·路德 Paul Rudd 饰）由于劫富济贫进了监狱，出狱后的他为了争取看望女儿的权利又走上了盗窃之路。没想到一次意外的偷盗事件让他成为了新一代“蚁人”，老蚁人汉克.皮姆博士（

　　趁布玛和龟仙人不注意，色色的乌龙（龙田直树 配音）偷出龙珠探测器，与悟饭（野泽雅子 配音）前往寒冷的兹鲁麦普雪山寻找聚在一起的龙珠。此时此刻，邪气逼人的克勤博士（矢田耕司 配音）早已捷足先登召唤神

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　　三只小猪驾着自己的飞船，踏上了前往“甜甜圈星球”的旅途。不料飞船遇到白洞的喷射，坠落在冰冻星球，偶遇人造外星人豆豆，并和豆豆成为了好朋友。但他们在护送豆豆回家的途中遇到了邪恶博士，并被告知豆豆是“

　　在未来世界，由于痛失爱子，天才科学家天马博士（尼古拉斯·凯奇 Nicolas Cage 配音）创造出了机械人阿童木（弗莱迪·海默 Freddie Highmore 配音），想以此来作为儿子的替身，

　　本片剧情接续原本电影，叙述在史迪奇这“626号实验品”之前，强霸博士已有好几百个失败实验产物，如今强霸居然把这些实验产物全都偷偷走私到地球。心怀不轨的越狱者仓鼠飞轮和被开除而怀恨在心的刚图舰长联手